bioinformatics吐下槽

普渡哥

坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing

一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。

另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？



所以有点想：
1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么

2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题

大家来说说看法吧。谢谢

sevensevens

普渡哥在读bioinfo？

1.不知道你现在的lab什么状况~其实如果你当初没有求着他让你进去~而是很平等那样进去的话~你想转他会理解的~除非他很坏。我建议还是能留就留吧，在不成熟的lab有个好处就是什么成就你都能沾边。

2.CS远远不止coding那么简单，你去申CS基本没可能有什么好的地方要你的，你CS背景不够。我是读CS的，想转BioInfo呢。到处都很少bioinfo的信息~我来这里一搜看到这个帖子~还蛮有趣的~我想去读你的，你想来读我的哈哈。。。